广州大学荔湾研究院（研究生院）建设主要由院士和学科领域领军人才领衔的高水平科研机构，研究院首批设岭南文化艺术数字活化与文创中心、岭南音乐舞蹈传习与研究中心、岭南建筑文化研究中心、广府文化研究中心、广州十三行研究中心、粤港澳大湾区语言服务与文化传承研究中心、智能图形图像实验室共计七个高水平科研中心团队；设广绣、粤剧、粤曲、广东音乐、古琴等非遗传承人工作坊。

设立荔湾研究院（研究生院）行政管理办公室，作为学校管理荔湾研究生院建设和运行的派出机构，落实学校与荔湾区政府的沟通协调任务，承担荔湾研究院（研究生院）的党建、研究生教育、科研管理以及综合辅助服务职能。